Etude FarmResist: Occupational risks for animal farmers to be colonised with animal-associated resistant bacteria in Thailand, impact on the faecal microbiota

Cette étude examinera le risque professionnel pour les éleveurs de porcs et de volailles de petites fermes familiales et d’élevages, de taille moyenne, d'être colonisés par des entérobactéries produisant des béta-lactamases (ESBL-E) et des entérobactéries résistantes à la colistine.

Dans chaque ferme, des échantillons fécaux d'agriculteurs, de leurs animaux et de rongeurs capturés autour de la ferme seront collectés. La prévalence, le génotypage des souches résistantes seront déterminés (Whole Genome Sequencing).  La dynamique de transmission des gènes de résistance de l’animal à l’homme sera étudiée.

De plus, l'association entre les caractéristiques de la ferme et la résistance aux antimicrobiens sera analysée afin de proposer des mesures préventives pour éviter la transmission des bactéries zoonotiques de l'animal aux agriculteurs et pour réduire la propagation de l'antibiorésistance dans l'environnement. En outre, l'influence du portage d’ESBL-E ou de souches résistantes à la colistine sur le microbiote fécal des agriculteurs sera étudiée.

Un doctorant de Thaïlande travaillera sur cette étude et viendra faire une partie des analyses en Suisse.