Gestion des échantillons biologiques: planification

Certains projets de recherche ont recours à des collectes d’échantillons biologiques pour répondre à la question de recherche et/ou assurer la sécurité des participantes et participants. Cette cible vise à renseigner les bonnes pratiques et ressources à disposition à Unisanté. De plus, un projet de recherche incluant des prélèvements biologiques peut bénéficier d’une valorisation importante grâce à la conservation d’échantillons biologiques en vue d’analyses ultérieures, planifiées ou non lors de la conception du projet. C’est pourquoi il est important de réfléchir à la longévité de son projet de recherche et à la possibilité d'enrichir la question de recherche initiale par des questions ultérieures ainsi que des collaborations scientifiques.

Pour les projets soumis à loi fédérale relative à la recherche sur l’être humain (LRH), les ordonnances d’application régissent les exigences en matière de collecte, d’utilisation, de réutilisation et de conservation des échantillons biologiques. 

La gestion des échantillons (ou «biobanking» en anglais) est un processus complexe qui inclut la collecte des échantillons (prélèvements), le transport, la préparation, la conservation, ainsi que la mise à disposition des échantillons pour les analyses. Ce processus doit être réalisée par du personnel spécialisé.

Avant même de commencer un projet de recherche, il est important de planifier la gestion des échantillons biologiques tout au long du processus de recherche. Les éléments essentiels à considérer lors de cette planification et à intégrer dans le protocole et/ou dans le manuel de laboratoire, sont listés ci-dessous. A noter que le type d’échantillons, la quantité prélevée et le calendrier des prélèvements doivent également être intégrés dans la feuille d’information et consentement.

1. Intégrer dans la demande de fonds les différents coûts associés à la collecte ou réutilisation, aux mesures de biomarqueurs et à la conservation des échantillons (si applicable).
    
2. Définir le type de projet
       a) Projet avec prélèvement d’échantillons biologiques:
           - Avec préparation des échantillons
           - Sans préparation des échantillons
           - Avec conservation des échantillons
           - Sans conservation des échantillons
       b) Projet avec réutilisation d’échantillons biologiques, issus d’une biobanque certifiée:
           - Avec préparation des échantillons
           - Sans préparation des échantillons
    
3. Définir, en fonction de la question de recherche et/ou de la gestion de la sécurité, le type d’échantillons (ex: sang, urine, etc) à utiliser ou réutiliser afin de permettre les mesures appropriées, enrichir la question de recherche et favoriser les collaborations ultérieures, le cas échéant.
    
4. Pour les projets avec prélèvement d’échantillons biologiques, établir le calendrier des prélèvements des échantillons et planifier les conditions les prélèvements auprès des participantes et participants, en accord avec les contraintes du projet et des spécificités des biomarqueurs à mesurer. 
   Pour les projets avec réutilisation d’échantillons biologiques, définir précisément quels échantillons seront réutilisés, et issus de quelle(s) biobanque(s).
    
5. Sélectionner le ou les laboratoire(s) de pré-traitements et/ou d’analyses et vérifier avec lui/eux l’adéquation du matériel de prélèvements, ainsi que les étapes de pré-traitement et/ou de conservation (aspects pré-analytiques). Veiller aux éventuels aspects contractuels avec le laboratoire d’analyses (contrat en cas de collaboration scientifique, pas nécessaire en cas de mandat de service).
    
6. Conceptualiser la gestion et la documentation des données et métadonnées des échantillons. Pour ce faire, un logiciel de saisie permettant un suivi des modifications, tel que p. ex. REDCap, Pulse doit être utilisé.
    
7. Si applicable, organiser la conservation à long terme des échantillons, en vue de réutilisations non encore définies, dans une infrastructure de biobanque certifiée. Toute collection d’échantillons biologiques conservés pour valorisation dans le cadre d’un projet de recherche doit être certifiée par la Swiss Biobanking Platfom (SBP) pour que le protocole obtienne l’approbation de la commission d’éthique. Cette certification prend la forme d’un label (ex: VITA) attribué par la SBP, qui certifie que les processus de collection et de conservation respectent la réglementation et les bonnes pratiques en vigueur.